Skip to main content

Table 1 Comparison of ZILI, DIS and GGM based on simulated data

From: Identification of microbial interaction network: zero-inflated latent Ising model based approach

    

ZILI

 

DIS

 

GGM

Ï„

σ

n

 

TPR

FPR

 

TPR

FPR

 

TPR

FPR

10

0.5

60

 

0.8322

0.0110

 

0.0115

0.0008

 

0.1940

0.0347

  

120

 

0.9650

0.0024

 

0.0173

0.0006

 

0.0721

0.0058

 

1

60

 

0.7945

0.0123

 

0.0106

0.0007

 

0.0145

0.0059

  

120

 

0.9615

0.0043

 

0.0163

0.0005

 

0.1683

0.0051

 

2

60

 

0.2688

0.0256

 

0.0115

0.0010

 

0.0123

0.0061

  

120

 

0.5041

0.0187

 

0.0096

0.0003

 

0.0368

0.0046

40

0.5

60

 

0.7775

0.0134

 

0.0106

0.0009

 

0.1961

0.0274

  

120

 

0.9445

0.0059

 

0.0180

0.0005

 

0.1923

0.0056

 

1

60

 

0.7260

0.0139

 

0.0163

0.0007

 

0.1895

0.0276

  

120

 

0.9353

0.0067

 

0.0120

0.0003

 

0.1821

0.0057

 

2

60

 

0.2085

0.0247

 

0.016

0.0013

 

0.1328

0.030

  

120

 

0.4043

0.0194

 

0.0115

0.0004

 

0.0991

0.0055

80

0.5

60

 

0.4443

0.0217

 

0.0720

0.0086

 

0.2346

0.0465

  

120

 

0.6090

0.0148

 

0.1115

0.0071

 

0.2248

0.0144

 

1

60

 

0.4088

0.0214

 

0.0681

0.0085

 

0.2321

0.0477

  

120

 

0.6020

0.0149

 

0.1138

0.0071

 

0.2196

0.0146

 

2

60

 

0.1538

0.0247

 

0.0493

0.0084

 

0.1851

0.0514

  

120

 

0.2820

0.0207

 

0.0938

0.0065

 

0.1620

0.0142