Skip to main content

Table 1 Comparison of ZILI, DIS and GGM based on simulated data

From: Identification of microbial interaction network: zero-inflated latent Ising model based approach

     ZILI   DIS   GGM
τ σ n   TPR FPR   TPR FPR   TPR FPR
10 0.5 60   0.8322 0.0110   0.0115 0.0008   0.1940 0.0347
   120   0.9650 0.0024   0.0173 0.0006   0.0721 0.0058
  1 60   0.7945 0.0123   0.0106 0.0007   0.0145 0.0059
   120   0.9615 0.0043   0.0163 0.0005   0.1683 0.0051
  2 60   0.2688 0.0256   0.0115 0.0010   0.0123 0.0061
   120   0.5041 0.0187   0.0096 0.0003   0.0368 0.0046
40 0.5 60   0.7775 0.0134   0.0106 0.0009   0.1961 0.0274
   120   0.9445 0.0059   0.0180 0.0005   0.1923 0.0056
  1 60   0.7260 0.0139   0.0163 0.0007   0.1895 0.0276
   120   0.9353 0.0067   0.0120 0.0003   0.1821 0.0057
  2 60   0.2085 0.0247   0.016 0.0013   0.1328 0.030
   120   0.4043 0.0194   0.0115 0.0004   0.0991 0.0055
80 0.5 60   0.4443 0.0217   0.0720 0.0086   0.2346 0.0465
   120   0.6090 0.0148   0.1115 0.0071   0.2248 0.0144
  1 60   0.4088 0.0214   0.0681 0.0085   0.2321 0.0477
   120   0.6020 0.0149   0.1138 0.0071   0.2196 0.0146
  2 60   0.1538 0.0247   0.0493 0.0084   0.1851 0.0514
   120   0.2820 0.0207   0.0938 0.0065   0.1620 0.0142