Skip to main content

Table 3 Results for the Cox’s regression model and Cox’s robust (both proposals) for the TCGA data with 22 genes

From: Identification of influential observations in high-dimensional cancer survival data through the rank product test

  Cox CoxRobust ([3]) CoxRobust ([4])
Genes coef se(coef) p-value coef se(coef) p-value estimate SE p-value
AKT1 -0.1991 0.1028 0.0526 -0.1793 0.1714 0.2954 -0.1794 0.1054 0.0888
BARD1 -0.0363 0.1145 0.7512 -0.0471 0.1227 0.7010 -0.0473 0.1118 0.6724
BRCA1 0.0984 0.1595 0.5375 0.1467 0.2017 0.4669 0.1462 0.1657 0.3776
BRCA2 0.4940 0.2114 0.0194 0.4092 0.2403 0.0886 0.4093 0.2195 0.0623
BRIP1 -0.2211 0.2395 0.3558 -0.1447 0.2869 0.6141 -0.1446 0.2541 0.5694
CDH1 0.0377 0.1422 0.7908 -0.0133 0.1903 0.9441 -0.0135 0.1790 0.9400
CHEK2 -0.1278 0.1007 0.2045 -0.0877 0.1118 0.4325 -0.0875 0.1043 0.4012
CTNNB1 0.1986 0.1702 0.2433 0.1555 0.2419 0.5204 0.1554 0.1673 0.3530
MLH1 0.0662 0.1443 0.6464 0.0004 0.1541 0.9981 0.0004 0.1530 0.9977
MRE11A -0.1625 0.2097 0.4385 -0.2578 0.3052 0.3983 -0.2577 0.2133 0.2270
MSH2 0.0412 0.1340 0.7588 0.1081 0.2364 0.6475 0.1083 0.1331 0.4159
MSH6 0.0441 0.2101 0.8339 -0.0298 0.3432 0.9309 -0.0298 0.1953 0.8789
NBN 0.1908 0.1149 0.0967 0.1790 0.1530 0.2420 0.1790 0.1256 0.1542
OPCML 0.3367 0.3194 0.2919 0.3620 0.3162 0.2522 0.3616 0.2366 0.1264
PALB2 -0.4238 0.1385 0.0022 -0.3886 0.2140 0.0694 -0.3884 0.1522 0.0107
PARK2 0.7468 0.5007 0.1358 0.6960 0.6044 0.2495 0.6957 0.5059 0.1690
PIK3CA 0.0086 0.1012 0.9326 0.0426 0.1171 0.7157 0.0427 0.1067 0.6893
PMS2 0.1267 0.1210 0.2951 0.1077 0.1561 0.4901 0.1078 0.1265 0.3940
RAD50 0.1426 0.1317 0.2789 0.1794 0.1527 0.2402 0.1792 0.1439 0.2129
RAD51C -0.0955 0.1163 0.4114 -0.0844 0.1383 0.5418 -0.0844 0.1210 0.4857
STK11 0.0616 0.3449 0.8582 0.1420 0.3867 0.7134 0.1422 0.3641 0.6960
TP53 -0.0485 0.0624 0.4371 -0.0521 0.0908 0.5659 -0.0520 0.0665 0.4339
  1. Highlighted in bold are statistically significant genes, in this case BRCA2 and PALB2