Skip to main content

Table 3 Results for the Cox’s regression model and Cox’s robust (both proposals) for the TCGA data with 22 genes

From: Identification of influential observations in high-dimensional cancer survival data through the rank product test

 

Cox

CoxRobust ([3])

CoxRobust ([4])

Genes

coef

se(coef)

p-value

coef

se(coef)

p-value

estimate

SE

p-value

AKT1

-0.1991

0.1028

0.0526

-0.1793

0.1714

0.2954

-0.1794

0.1054

0.0888

BARD1

-0.0363

0.1145

0.7512

-0.0471

0.1227

0.7010

-0.0473

0.1118

0.6724

BRCA1

0.0984

0.1595

0.5375

0.1467

0.2017

0.4669

0.1462

0.1657

0.3776

BRCA2

0.4940

0.2114

0.0194

0.4092

0.2403

0.0886

0.4093

0.2195

0.0623

BRIP1

-0.2211

0.2395

0.3558

-0.1447

0.2869

0.6141

-0.1446

0.2541

0.5694

CDH1

0.0377

0.1422

0.7908

-0.0133

0.1903

0.9441

-0.0135

0.1790

0.9400

CHEK2

-0.1278

0.1007

0.2045

-0.0877

0.1118

0.4325

-0.0875

0.1043

0.4012

CTNNB1

0.1986

0.1702

0.2433

0.1555

0.2419

0.5204

0.1554

0.1673

0.3530

MLH1

0.0662

0.1443

0.6464

0.0004

0.1541

0.9981

0.0004

0.1530

0.9977

MRE11A

-0.1625

0.2097

0.4385

-0.2578

0.3052

0.3983

-0.2577

0.2133

0.2270

MSH2

0.0412

0.1340

0.7588

0.1081

0.2364

0.6475

0.1083

0.1331

0.4159

MSH6

0.0441

0.2101

0.8339

-0.0298

0.3432

0.9309

-0.0298

0.1953

0.8789

NBN

0.1908

0.1149

0.0967

0.1790

0.1530

0.2420

0.1790

0.1256

0.1542

OPCML

0.3367

0.3194

0.2919

0.3620

0.3162

0.2522

0.3616

0.2366

0.1264

PALB2

-0.4238

0.1385

0.0022

-0.3886

0.2140

0.0694

-0.3884

0.1522

0.0107

PARK2

0.7468

0.5007

0.1358

0.6960

0.6044

0.2495

0.6957

0.5059

0.1690

PIK3CA

0.0086

0.1012

0.9326

0.0426

0.1171

0.7157

0.0427

0.1067

0.6893

PMS2

0.1267

0.1210

0.2951

0.1077

0.1561

0.4901

0.1078

0.1265

0.3940

RAD50

0.1426

0.1317

0.2789

0.1794

0.1527

0.2402

0.1792

0.1439

0.2129

RAD51C

-0.0955

0.1163

0.4114

-0.0844

0.1383

0.5418

-0.0844

0.1210

0.4857

STK11

0.0616

0.3449

0.8582

0.1420

0.3867

0.7134

0.1422

0.3641

0.6960

TP53

-0.0485

0.0624

0.4371

-0.0521

0.0908

0.5659

-0.0520

0.0665

0.4339

  1. Highlighted in bold are statistically significant genes, in this case BRCA2 and PALB2