Skip to main content

Table 1 Results for the Cox’s regression model and Cox’s robust (both proposals) for the TCGA data with 63 genes

From: Identification of influential observations in high-dimensional cancer survival data through the rank product test

 

Cox

CoxRobust ([3])

CoxRobust ([4])

Genes

coef

se(coef)

p-value

coef

se(coef)

p-value

estimate

SE

p-value

HPCA

-1.1893

0.3560

0.0008

-1.1803

0.5877

0.0446

-1.1662

0.3387

0.0006

UBE2J1

-0.2160

0.1475

0.1431

-0.2221

0.2676

0.4064

-0.2220

0.1364

0.1035

RPS6KA2

0.2972

0.1124

0.0082

0.3892

0.1408

0.0057

0.3980

0.1201

0.0009

SDF2L1

-0.2025

0.1024

0.0480

-0.2003

0.1203

0.0959

-0.1979

0.1017

0.0516

GRB7

0.3360

0.0965

0.0005

0.3268

0.1115

0.0034

0.3272

0.0873

0.0002

PTGFR

1.1771

0.4891

0.0161

1.0255

0.6001

0.0875

1.0131

0.4899

0.0386

ABCD2

2.1329

0.7532

0.0046

2.3397

1.1928

0.0498

2.3564

0.7860

0.0027

FLJ20323

0.2936

0.1322

0.0264

0.2696

0.1480

0.0685

0.2654

0.1251

0.0338

WDR76

1.1471

0.3040

0.0002

1.1701

0.5071

0.0210

1.1695

0.3387

0.0006

NDUFA3

0.3454

0.1352

0.0106

0.4128

0.1633

0.0115

0.4130

0.1289

0.0014

FJX1

-0.1945

0.0987

0.0488

-0.2867

0.1616

0.0760

-0.2934

0.1023

0.0041

GAPDHS

0.8798

0.5092

0.0840

0.9733

0.6198

0.1163

0.9929

0.5517

0.0719

RAB40B

-0.1852

0.0833

0.0263

-0.2219

0.1404

0.1140

-0.2232

0.0838

0.0077

PRR16

-0.4071

0.1887

0.0310

-0.3362

0.2740

0.2198

-0.3367

0.1863

0.0707

CLTCL1

0.3730

0.2601

0.1515

0.4470

0.3452

0.1953

0.4354

0.2817

0.1223

PPM2C

0.3999

0.1005

0.0001

0.4173

0.2192

0.0569

0.4160

0.1027

0.0001

FOXE3

-0.8118

0.5080

0.1100

-0.5162

0.6139

0.4005

-0.5129

0.4706

0.2757

CHIT1

-0.9427

0.2741

0.0006

-0.9042

0.4674

0.0531

-0.9102

0.3584

0.0111

PI3

0.2450

0.0466

0.0000

0.2305

0.1083

0.0333

0.2310

0.0443

0.0000

BNC1

0.1648

0.0693

0.0174

0.1830

0.0847

0.0307

0.1837

0.0731

0.0120

D4S234E

-0.1471

0.0606

0.0153

-0.1645

0.0767

0.0319

-0.1664

0.0636

0.0089

SAPS2

0.8055

0.2158

0.0002

0.8342

0.6100

0.1714

0.8345

0.2133

0.0001

CSNK1G1

0.8805

0.3858

0.0225

1.0782

0.4489

0.0163

1.0874

0.3901

0.0053

MLL2

1.0106

0.4972

0.0421

1.3137

0.8978

0.1434

1.3255

0.5169

0.0103

HSPB7

0.6657

0.3540

0.0600

0.5092

0.4368

0.2437

0.5004

0.3526

0.1559

SLC37A4

-0.2538

0.1635

0.1205

-0.3065

0.2269

0.1768

-0.3142

0.1653

0.0573

WTAP

0.5562

0.1590

0.0005

0.5607

0.3265

0.0860

0.5599

0.1563

0.0003

SSTR1

-1.7443

0.6359

0.0061

-1.7979

0.7908

0.0230

-1.8039

0.6710

0.0072

IDUA

1.4248

0.4480

0.0015

1.4354

0.8810

0.1032

1.4447

0.4714

0.0022

PSG3

-2.1008

0.7371

0.0044

-2.3029

0.8579

0.0073

-2.2998

0.7673

0.0027

SLC9A2

0.3374

0.1267

0.0077

0.3185

0.1677

0.0575

0.3179

0.1311

0.0153

PAPOLG

1.8006

0.4837

0.0002

1.7430

0.9548

0.0679

1.7445

0.4623

0.0002

GAS1

0.2589

0.0861

0.0027

0.2756

0.1380

0.0458

0.2785

0.0854

0.0011

ELA3A

-0.4516

0.2360

0.0557

-0.4692

1.1530

0.6840

-0.4715

0.2266

0.0375

KIF26B

0.9000

0.2329

0.0001

0.8508

0.4996

0.0886

0.8502

0.2299

0.0002

GBP2

-0.3527

0.0935

0.0002

-0.3718

0.1924

0.0532

-0.3749

0.0959

0.0001

POPDC2

-3.0285

0.4894

0.0000

-2.7792

1.2267

0.0235

-2.7675

0.5214

0.0000

OPN1SW

2.3693

0.5099

0.0000

2.1049

1.0821

0.0518

2.1140

0.5087

0.0000

DAP

-0.7017

0.1333

0.0000

-0.6959

0.2120

0.0010

-0.6957

0.1307

0.0000

SRY

-2.3810

0.7835

0.0024

-2.4342

1.0015

0.0151

-2.4382

0.7497

0.0011

UTP20

0.3955

0.1553

0.0109

0.4170

0.2133

0.0506

0.4185

0.1589

0.0084

HOXD11

0.8313

0.2268

0.0003

0.7056

0.2897

0.0149

0.7047

0.2147

0.0010

HSPA1L

0.3765

0.1828

0.0395

0.4634

0.2344

0.0480

0.4645

0.2207

0.0353

PPP3CA

0.3213

0.1113

0.0039

0.3294

0.1262

0.0091

0.3316

0.1019

0.0011

PAX2

-0.2296

0.0899

0.0106

-0.2373

0.2193

0.2792

-0.2375

0.0869

0.0063

FZD10

-0.0994

0.0553

0.0720

-0.0801

0.0748

0.2841

-0.0807

0.0563

0.1518

TREML2

-0.6339

0.4228

0.1339

-0.6043

0.5415

0.2644

-0.6143

0.4665

0.1879

CCR7

-0.6175

0.2637

0.0192

-0.5713

0.4291

0.1830

-0.5692

0.2349

0.0154

MPZ

0.8243

0.2329

0.0004

0.7611

0.3173

0.0164

0.7626

0.2097

0.0003

MGAT4C

1.1627

0.6331

0.0663

1.0216

0.6915

0.1396

1.0177

0.5374

0.0583

EHMT1

1.8125

0.4705

0.0001

1.5360

1.0943

0.1604

1.5220

0.4978

0.0022

ALG8

-0.2209

0.1067

0.0385

-0.1276

0.1482

0.3894

-0.1188

0.1135

0.2950

KCNN2

-1.1298

0.3040

0.0002

-1.1903

1.0630

0.2628

-1.1909

0.2916

0.0000

ESR2

-2.6987

1.0408

0.0095

-2.4160

1.7091

0.1575

-2.4447

1.1388

0.0318

TGM2

-0.2265

0.1370

0.0982

-0.1904

0.2393

0.4262

-0.1907

0.1667

0.2526

LBP

1.0330

0.2216

0.0000

0.9934

0.2712

0.0002

0.9919

0.2492

0.0001

SRPK3

-0.7770

0.2074

0.0002

-0.8033

0.4268

0.0599

-0.8068

0.1927

0.0000

FBXO40

1.4431

0.5331

0.0068

1.3587

0.7145

0.0572

1.3517

0.5519

0.0143

ANGPT2

-0.3112

0.1571

0.0477

-0.3140

0.1849

0.0894

-0.3151

0.1393

0.0237

IRF5

-0.8805

0.3143

0.0051

-0.8175

0.5146

0.1121

-0.8176

0.3097

0.0083

ANXA4

0.2854

0.1191

0.0166

0.2839

0.1674

0.0900

0.2852

0.1350

0.0346

DENND2D

-0.2540

0.1053

0.0159

-0.2419

0.1388

0.0813

-0.2416

0.0957

0.0116

SGEF

-1.4599

0.6064

0.0161

-1.4272

0.8081

0.0774

-1.4264

0.6434

0.0266