Table 2 FDR adjusted P-value in global testing

SNP (GxG)

Removed

Score

KS

Inverse chi

Inversenorm

Logit

Wilcoxon

Tippett

25(300)

0.29121

0.22008

1.00000

1.00000

0.80991

0.33927

24(276)

rs35252139

−0.0308

0.21644

0.12424

1.00000

1.00000

0.55397

0.33340

23(253)

rs35229708

−0.0308

0.16697

0.06603

1.00000

1.00000

0.43198

0.32718

22(231)

rs2298383

−0.0279

0.13417

0.03087

1.00000

1.00000

0.25182

0.32062

21(210)

rs12995526

−0.0250

0.16987

0.05667

1.00000

1.00000

0.45717

0.31374

20(190)

rs7699188

−0.0202

0.11033

0.01793

1.00000

1.00000

0.31680

0.30658

19(171)

rs1805087

−0.0183

0.03887

0.00320

1.00000

1.00000

0.18665

0.29916

18(153)

rs4149056

−0.0067

0.02048

0.00106

1.00000

1.00000

0.09019

0.29154

17(136)

55930652

−0.0038

0.01051

0.00080

1.00000

1.00000

0.10254

0.28376

16(120)

* no rs [35]

−0.0029

0.00455

0.00016

1.00000

1.00000

0.02642

0.27592

15(105)

rs17803441

0.0010

0.00312

0.00011

1.00000

1.00000

0.00567

0.26811

14(91)

rs34743033

0.0087

0.00022

0.00001

1.00000

1.00000

0.00015

0.26049

13(78)

rs61886492

0.0096

0.00022

0.00000

0.00001

0.00000

0.00006

0.25328

12(66)

rs71391718

0.0183

0.00008

0.00000

0.00000

0.00000

0.00001

0.25328

11(55)

rs3758149

0.0192

0.00008

0.00000

0.00000

0.00000

0.00006

0.25328

10(45)

rs1801131

0.0240

0.00026

0.00004

0.00004

0.00004

0.00016

0.25328

9(36)

rs1801394

0.0365

0.00022

0.00004

0.00003

0.00003

0.00015

0.25328

8(28)

rs8788

0.0375

0.00008

0.00003

0.00002

0.00002

0.00015

0.25328

7(21)

rs7387

0.0452

0.01051

0.00255

0.00547

0.00442

0.00799

0.25328

6(15)

rs1801133

0.0481

0.05212

0.06679

0.10791

0.12185

0.05337

0.25328

5(10)

rs8971

0.0481

4(6)

rs2274976

0.0644

3(3)

rs1979277

0.0673

2(1)

rs11280056

0.0702

rs3733890

0.0750

rs3733890

0.1163

5

4

11

11

8

Not Found