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Table 3 Birdsuite Agreement with qPCR calls in 18 genomic regions

From: A comparison of genomic copy number calls by Partek Genomics Suite, Genotyping Console and Birdsuite algorithms to quantitative PCR

Region 0 1 2 3
2:242,648,367 0 (0) 1 (0) 36 (0) 0 (0)
3:53,010,599 1 (0) 2 (1) 30 (0) 0 (0)
3:180,366,781 0 (0) 0 (0) 16 (0) 0 (0)
7:11,288,419 0 (0) 0 (0) 26 (0) 0 (0)
7:24,002,710 0 (0) 0 (0) 16 (0) 0 (0)
7:133,441,893 2 (0) 14 (0) 6 (0) 0 (0)
8:51,195,001 1 (0) 11 (2) 13 (0) 0 (0)
8:144,776,429 1 (0) 5 (2) 10 (2) 0 (0)
9:16,930,899 0 (0) 0 (0) 16 (0) 0 (0)
13:53,784,055 0 (0) 0 (0) 18 (0) 0 (0)
13:56,713,547 0 (0) 0 (0) 13 (4) 0 (0)
13:71,376,533 7 (0) 12 (1) 1 (0) 0 (0)
15:32,555,299 0 (0) 3 (0) 16 (0) 0 (0)
16:3,104,307 0 (0) 0 (0) 18 (0) 0 (0)
16:4,280,826 0 (0) 0 (1) 15 (0) 0 (0)
16:18,557,305 0 (0) 0 (0) 26 (0) 0 (0)
20:29,271,114 0 (0) 0 (0) 8 (0) 0 (1)
22:47,400,722 0 (0) 0 (0) 29 (0) 0 (0)
  1. aValues are represented as the number of calls that "agree(disagree)"