Skip to main content

Table 1 Standard 2D HP instances used as benchmark

From: Hill-Climbing search and diversification within an evolutionary approach to protein structure prediction

Inst.

Length

Sequence

E*

S1

20

1H 1P 1H 2P 2H 1P 1H 2P 1H 1P 2H 2P 1H 1P 1H

-9

S2

24

2H 2P 1H 2P 1H 2P 1H 2P 1H 2P 1H 2P 1H 2P 2H

-9

S3

25

2P 1H 2P 2H 4P 2H 4P 2H 4P 2H

-8

S4

36

3P 2H 2P 2H 5P 7H 2P 2H 4P 2H 2P 1H 2P

-14

S5

48

2P 1H 2P 2H 2P 2H 5P 10H 6P 2H 2P 2H 2P 1H 2P 5H

-23

S6

50

2H 1P 1H 1P 1H 1P 1H 1P 4H 1P 1H 3P 1H 3P 1H 4P 1H

3P 1H 3P 1H 1P 4H 1P 1H 1P 1H 1P 1H 1P 1H 1H

-21

S7

60

2P 3H 1P 8H 3P 10H 1P 1H 3P 12H 4P 6H 1P 2H 1P 1H 1P

-36

S8

64

12H 1P 1H 1P 1H 2P 2H 2P 2H 2P 1H 2P 2H 2P 2H

2P 1H 2P 2H 2P 2H 2P 1H 1P 1H 1P 12H

-42