Skip to main content

Table 1 Standard 2D HP instances used as benchmark

From: Hill-Climbing search and diversification within an evolutionary approach to protein structure prediction

Inst. Length Sequence E*
S1 20 1H 1P 1H 2P 2H 1P 1H 2P 1H 1P 2H 2P 1H 1P 1H -9
S2 24 2H 2P 1H 2P 1H 2P 1H 2P 1H 2P 1H 2P 1H 2P 2H -9
S3 25 2P 1H 2P 2H 4P 2H 4P 2H 4P 2H -8
S4 36 3P 2H 2P 2H 5P 7H 2P 2H 4P 2H 2P 1H 2P -14
S5 48 2P 1H 2P 2H 2P 2H 5P 10H 6P 2H 2P 2H 2P 1H 2P 5H -23
S6 50 2H 1P 1H 1P 1H 1P 1H 1P 4H 1P 1H 3P 1H 3P 1H 4P 1H
3P 1H 3P 1H 1P 4H 1P 1H 1P 1H 1P 1H 1P 1H 1H
-21
S7 60 2P 3H 1P 8H 3P 10H 1P 1H 3P 12H 4P 6H 1P 2H 1P 1H 1P -36
S8 64 12H 1P 1H 1P 1H 2P 2H 2P 2H 2P 1H 2P 2H 2P 2H
2P 1H 2P 2H 2P 2H 2P 1H 1P 1H 1P 12H
-42